लेज़रों के साथ सबसे बड़ा सुरक्षा मुद्दा मानव आंखों और त्वचा को होने वाला संभावित नुकसान है।
लेज़र से प्रकाश की एक केंद्रित किरण निकलती है जो उचित सुरक्षा सावधानियों के अभाव में आँख की रेटिना और त्वचा को नुकसान पहुँचा सकती है। यही कारण है कि लेज़र का उपयोग करते समय लेज़र सुरक्षात्मक आईवियर का उपयोग करना और निर्माता के दिशा-निर्देशों का पालन करना महत्वपूर्ण है।
इसके अतिरिक्त, यदि लेज़रों का अनुचित तरीके से उपयोग किया जाए तो वे आग या विस्फोट का कारण बन सकते हैं, इसलिए उन्हें सावधानी से संभालना आवश्यक है।
हालांकि, जब तक सुरक्षा उपाय किए जाते हैं, तब तक लेज़र चिकित्सा, विनिर्माण और अनुसंधान जैसे उद्योगों में विभिन्न अनुप्रयोगों के लिए एक सुरक्षित और अविश्वसनीय रूप से उपयोगी उपकरण हो सकता है।